Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms