Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC3Q9NUD5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC3Q9NUD5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC3Q9NUD5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC3Q9NUD5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC3Q9NUD5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZCCHC3Q9NUD5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms