Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPNPEP3Q9NQH7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms