Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hdgfl3Q9JMG7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hdgfl3Q9JMG7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms