Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LratQ9JI60 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LratQ9JI60 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LratQ9JI60 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LratQ9JI60 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LratQ9JI60 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LratQ9JI60 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LratQ9JI60 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms