Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSM14BQ9BX40 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms