Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EYA3Q99504 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms