Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
YME1L1Q96TA2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms