Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CMTM3Q96MX0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CMTM3Q96MX0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms