Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGBD4Q96DM1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGBD4Q96DM1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms