Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAF2Q96CS3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAF2Q96CS3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms