Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX54Q8TDD1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
DDX54Q8TDD1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX54Q8TDD1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms