Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rasgef1bQ8JZL7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rasgef1bQ8JZL7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms