Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN05

Ap1s3, AP-1 complex subunit sigma-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s3Q7TN05 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ap1s3Q7TN05 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms