Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TPGS1Q6ZTW0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPGS1Q6ZTW0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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