Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vat1Q62465 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vat1Q62465 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms