Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYT16Q17RD7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms