Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ZNF235Q14590 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ZNF235Q14590 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ZNF235Q14590 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF235Q14590 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF235Q14590 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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