Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP1A4Q13733 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP1A4Q13733 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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