Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 DUF1YOL087C 3351 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 ARP8YOR141C 2646 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 MDM36YPR083W 1740 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 SWC4YGR002C 1431 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 AYT1YLL063C 1425 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 UBX3YDL091C 1368 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 ARF1YDL192W 546 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 DIG2YDR480W 972 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 SLD5YDR489W 885 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 AIM11YER093C-A 414 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 SDP1YIL113W 630 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YJR087WYJR087W 351 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YET1YKL065C 621 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YMR254CYMR254C 309 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YNL235CYNL235C 432 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 RPC40YPR110C 1008 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 SUS1YBR111W-A 291 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 SMC2YFR031C 3513 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YCT1YLL055W 1596 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 NDC80YIL144W 2076 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 PEX6YNL329C 3093 nt3.04□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 DUN1YDL101C 1542 nt3.03□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 MFB1YDR219C 1398 nt3.03□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YCR013CYCR013C 648 nt3.03□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YDR090CYDR090C 933 nt3.03□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 THO1YER063W 657 nt3.03□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 SMX2YFL017W-A 234 nt3.03□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt3.03□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YIL082WYIL082W 873 nt3.03□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 IRC3YDR332W 2070 nt3.03□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 FUS2YMR232W 2034 nt3.03□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 VIP1YLR410W 3441 nt3.03□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YLR001CYLR001C 2589 nt3.03□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 HAA1YPR008W 2085 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YHR078WYHR078W 1659 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YLR446WYLR446W 1302 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 snR5snR5 204 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 PBP4YDL053C 558 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YGR017WYGR017W 894 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YGR293CYGR293C 462 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 STE18YJR086W 333 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 AIM25YJR100C 984 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YLR012CYLR012C 300 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 RNH203YLR154C 333 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 HHF2YNL030W 312 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YNL184CYNL184C 327 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 MPP6YNR024W 561 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 RSM19YNR037C 276 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 MIX23YBL107C 591 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 ARF3YOR094W 552 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YPR170CYPR170C 336 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YPR172WYPR172W 603 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 ORC1YML065W 2745 nt3.02□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 MDV1YJL112W 2145 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 ANR2YKL047W 1551 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YGL039WYGL039W 1047 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 SAE2YGL175C 1038 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YGR073CYGR073C 372 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 VMA10YHR039C-A 345 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YHR212CYHR212C 336 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YIL141WYIL141W 390 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 RLP24YLR009W 600 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YAR060CYAR060C 336 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 ECI1YLR284C 843 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 ILV5YLR355C 1188 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 LTP1YPR073C 486 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 CUR1YPR158W 759 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 DSF2YBR007C 2211 nt3.01□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 LST4YKL176C 2487 nt3□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 RIF1YBR275C 5751 nt3□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YDL050CYDL050C 372 nt3□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YDR018CYDR018C 1191 nt3□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YAP5YIR018W 738 nt3□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 GMC2YLR445W 567 nt3□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 INP1YMR204C 1263 nt3□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 MEI5YPL121C 669 nt3□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YBR071WYBR071W 636 nt3□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 KEL2YGR238C 2649 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 ICR1ICR1 3199 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 SRD1YCR018C 666 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 DAD1YDR016C 285 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YDR262WYDR262W 819 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 THG1YGR024C 714 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 VMA21YGR105W 234 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YNL109WYNL109W 546 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 MPD2YOL088C 834 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YOL114CYOL114C 609 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 RCN2YOR220W 798 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 SLN1YIL147C 3663 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 POL4YCR014C 1749 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 SHE9YDR393W 1371 nt2.99□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 snR9snR9 187 nt2.98□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 FMN1YDR236C 657 nt2.98□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 ASG7YJL170C 630 nt2.98□□□□□ -1.93
LSP1Q12230 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.98□□□□□ -1.93
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