Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 TDA2YER071C 381 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 RPL30YGL030W 318 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YGL082WYGL082W 1146 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YLR271WYLR271W 825 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 CWC24YLR323C 780 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 MIX23YBL107C 591 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 CSM4YPL200W 471 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 MUD1YBR119W 897 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YBR300CYBR300C 498 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 NET1YJL076W 3570 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 DSF2YBR007C 2211 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 CIN8YEL061C 3003 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 NMA111YNL123W 2994 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 BOI1YBL085W 2943 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 KAR9YPL269W 1935 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 FAA2YER015W 2235 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 PCI8YIL071C 1335 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YLR446WYLR446W 1302 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 BCH1YMR237W 2175 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YHR213WYHR213W 597 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 CKA1YIL035C 1119 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 SRP21YKL122C 504 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 TDA8YAL064C-A 381 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YAR062WYAR062W 597 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 RRT16YNL105W 429 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 UTP15YMR093W 1542 nt3.03□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 PDC2YDR081C 2778 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 SCY1YGL083W 2415 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 MFB1YDR219C 1398 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 SMC2YFR031C 3513 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 snR9snR9 187 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YDR090CYDR090C 933 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 FAR7YFR008W 666 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YIL012WYIL012W 342 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YJR087WYJR087W 351 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 SEC14YMR079W 915 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YAP7YOL028C 738 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 NTO1YPR031W 2247 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YAT2YER024W 2772 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YKL222CYKL222C 2118 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YEL1YBL060W 2064 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 DRS2YAL026C 4068 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 FLO1YAR050W 4614 nt3.02□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 TCP1YDR212W 1680 nt3.01□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 RPN3YER021W 1572 nt3.01□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.01□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YGR053CYGR053C 852 nt3.01□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YJL119CYJL119C 324 nt3.01□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 IRC21YMR073C 606 nt3.01□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 AIM36YMR157C 768 nt3.01□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 PIS1YPR113W 663 nt3.01□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YSP2YDR326C 4317 nt3.01□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 VAS1YGR094W 3315 nt3.01□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 ALY1YKR021W 2748 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 SSP1YHR184W 1716 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 VHR1YIL056W 1923 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YCR090CYCR090C 549 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YDR018CYDR018C 1191 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 VMA21YGR105W 234 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 RSR1YGR152C 819 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 SFT1YKL006C-A 294 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 TPK2YPL203W 1143 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 snR42snR42 351 nt3□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 ROM1YGR070W 3468 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 RPN1YHR027C 2982 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 NCS2YNL119W 1482 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 PBS2YJL128C 2007 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 OCA6YDR067C 675 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YDR115WYDR115W 318 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YDR442WYDR442W 393 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 TCD1YHR003C 1290 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 CPR7YJR032W 1182 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 COX8YLR395C 237 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YNL150WYNL150W 408 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 ATG3YNR007C 933 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 SFM1YOR021C 642 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 HEM4YOR278W 828 nt2.99□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 MDM1YML104C 3384 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 MAK21YDR060W 3078 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 CHS2YBR038W 2892 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 COG2YGR120C 789 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 MTM1YGR257C 1101 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 RPS21BYJL136C 264 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 GMC2YLR445W 567 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 PDP3YLR455W 915 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 CSI1YMR025W 888 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 MRS2YOR334W 1413 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 FAR1YJL157C 2493 nt2.98□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 STE6YKL209C 3873 nt2.97□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 POL3YDL102W 3294 nt2.97□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 NEL1YHR035W 1893 nt2.97□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 SWC4YGR002C 1431 nt2.97□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 NCB2YDR397C 441 nt2.97□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 LST7YGR057C 729 nt2.97□□□□□ -1.93
NMD4Q12129 BAT1YHR208W 1182 nt2.97□□□□□ -1.93
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