Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3AQ05086 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms