Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
OC90Q02509 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
OC90Q02509 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
OC90Q02509 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
OC90Q02509 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OC90Q02509 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OC90Q02509 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
OC90Q02509 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OC90Q02509 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
OC90Q02509 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OC90Q02509 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
OC90Q02509 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
OC90Q02509 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms