Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BNC1Q01954 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BNC1Q01954 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BNC1Q01954 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
BNC1Q01954 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BNC1Q01954 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BNC1Q01954 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms