Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XPCQ01831 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XPCQ01831 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XPCQ01831 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
XPCQ01831 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
XPCQ01831 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
XPCQ01831 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
XPCQ01831 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
XPCQ01831 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
XPCQ01831 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
XPCQ01831 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
XPCQ01831 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XPCQ01831 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XPCQ01831 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
XPCQ01831 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
XPCQ01831 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
XPCQ01831 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
XPCQ01831 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
XPCQ01831 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
XPCQ01831 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
XPCQ01831 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
XPCQ01831 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
XPCQ01831 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
XPCQ01831 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms