Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoa1Q00623 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apoa1Q00623 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms