Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2BFSP57053 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms