Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ClgnP52194 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClgnP52194 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ClgnP52194 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms