Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBP50607 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBP50607 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBP50607 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBP50607 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBP50607 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBP50607 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TUBP50607 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBP50607 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBP50607 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBP50607 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBP50607 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBP50607 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBP50607 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBP50607 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBP50607 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TUBP50607 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TUBP50607 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBP50607 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBP50607 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBP50607 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBP50607 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBP50607 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBP50607 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBP50607 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBP50607 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBP50607 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBP50607 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TUBP50607 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TUBP50607 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms