Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GCLCP48506 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCLCP48506 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLCP48506 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLCP48506 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLCP48506 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLCP48506 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLCP48506 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLCP48506 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLCP48506 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCLCP48506 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCLCP48506 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCLCP48506 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCLCP48506 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCLCP48506 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCLCP48506 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCLCP48506 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLCP48506 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLCP48506 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLCP48506 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLCP48506 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLCP48506 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCLCP48506 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCLCP48506 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLCP48506 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLCP48506 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLCP48506 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLCP48506 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLCP48506 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLCP48506 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLCP48506 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLCP48506 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLCP48506 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLCP48506 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLCP48506 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLCP48506 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLCP48506 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLCP48506 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCLCP48506 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms