Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GTF2E2P29084 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms