Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LOXP28300 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LOXP28300 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LOXP28300 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LOXP28300 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LOXP28300 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXP28300 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXP28300 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXP28300 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LOXP28300 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXP28300 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXP28300 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXP28300 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXP28300 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXP28300 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXP28300 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXP28300 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXP28300 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXP28300 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXP28300 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LOXP28300 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LOXP28300 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms