Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpbP27790 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CenpbP27790 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CenpbP27790 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpbP27790 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms