Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GP1BBP13224 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GP1BBP13224 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms