Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP8B3O60423 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP8B3O60423 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms