Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
2610021A01RikE9Q0Q3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms