Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA6CA6NDK9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms