Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AGAP1Q9UPQ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AGAP1Q9UPQ3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms