Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AFF4Q9UHB7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AFF4Q9UHB7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms