Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Irx4Q9QY61 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms