Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LTBP3Q9NS15 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
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