Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms