Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX5Q9H2C1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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