Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc89Q9DA73 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc89Q9DA73 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms