Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RTRAFQ9CQE8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RTRAFQ9CQE8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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