Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00467Q9BRT7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms