Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC51Q96ER9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC51Q96ER9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms