Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SelenomQ8VHC3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SelenomQ8VHC3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms