Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc73Q8CDM4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc73Q8CDM4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms