Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTU1Q7Z7A3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTU1Q7Z7A3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTU1Q7Z7A3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTU1Q7Z7A3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms